Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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