Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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