Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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