Protein–RNA interactions for Protein: Q12982

BNIP2, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP2Q12982 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP2Q12982 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms