Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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