Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms