Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms