Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSG1Q02413 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms