Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms