Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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