Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM11AP58511 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM11AP58511 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM11AP58511 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM11AP58511 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM11AP58511 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM11AP58511 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM11AP58511 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM11AP58511 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms