Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP107P57740 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP107P57740 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms