Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSE1LP55060 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms