Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCCSP53701 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCCSP53701 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HCCSP53701 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HCCSP53701 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HCCSP53701 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HCCSP53701 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HCCSP53701 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HCCSP53701 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCCSP53701 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCCSP53701 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms