Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLCSP50747 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLCSP50747 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms