Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLK1P49759 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLK1P49759 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms