Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTPAP49638 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTPAP49638 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTPAP49638 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTPAP49638 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTPAP49638 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms