Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCLMP48507 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLMP48507 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms