Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms