Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms