Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP1P29466 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP1P29466 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP1P29466 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP1P29466 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP1P29466 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP1P29466 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP1P29466 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP1P29466 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms