Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms