Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFKBIAP25963 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms