Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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CTSSP25774 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CTSSP25774 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSSP25774 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CTSSP25774 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSSP25774 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CTSSP25774 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSSP25774 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSSP25774 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSSP25774 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSSP25774 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSSP25774 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CTSSP25774 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CTSSP25774 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CTSSP25774 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSSP25774 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSSP25774 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSSP25774 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CTSSP25774 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CTSSP25774 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSSP25774 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CTSSP25774 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CTSSP25774 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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