Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NTF3P20783 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NTF3P20783 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms