Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB1P18505 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB1P18505 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB1P18505 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms