Protein–RNA interactions for Protein: P15822

HIVEP1, Zinc finger protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 2,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1P15822 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIVEP1P15822 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIVEP1P15822 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIVEP1P15822 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIVEP1P15822 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms