Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRF1P14222 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRF1P14222 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRF1P14222 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PRF1P14222 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRF1P14222 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRF1P14222 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRF1P14222 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRF1P14222 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRF1P14222 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRF1P14222 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRF1P14222 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRF1P14222 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRF1P14222 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRF1P14222 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRF1P14222 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRF1P14222 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRF1P14222 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRF1P14222 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRF1P14222 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRF1P14222 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms