Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms