Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDH1P12830 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH1P12830 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms