Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFLP07196 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms