Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms