Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms