Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTNP04004 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTNP04004 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTNP04004 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTNP04004 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms