Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9P02748 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9P02748 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9P02748 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9P02748 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9P02748 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9P02748 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9P02748 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9P02748 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9P02748 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9P02748 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9P02748 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms