Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3BO95985 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms