Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POP4O95707 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POP4O95707 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POP4O95707 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms