Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBL3O95164 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBL3O95164 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBL3O95164 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBL3O95164 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms