Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRMUO75648 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms