Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms