Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SCN2BO60939 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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