Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB3O43889 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB3O43889 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB3O43889 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms