Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTDSP2O14595 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTDSP2O14595 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTDSP2O14595 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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