Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms