Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVW-1Q9UQF0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms