Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms