Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms