Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms