Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms