Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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